Velký bariérový útes obývají barevné ryby zvané klaun. Jeden z nich jménem Marlin se potýká s tragédií. Dravá ryba pohltí jeho manželku Coral a téměř všechna vejce vajíček, z nichž se mladí klauni chystali každý den vylíhnout. Malý Nemo, jediný přežívající Marlinův syn, se stává smyslem jeho života. Když se však nadměrný otec rozhodne poslat ho do školy, dojde k dalšímu neštěstí: malý klaun je potápěčem vyloven z oceánu a jde do akvária v zubařské kanceláři v Sydney. Přestože Marlin trpí strachem z otevřeného oceánu, snaží se zachránit svého syna. Doprovází ho velká zapomnětlivá Dora.
