След няколко седмици във Филипините, Магелан е обърнал към християнството около 2200 местни жители, включително Раджа Хумабон от Себу и повечето лидери на островите около Себу.[27] Въпреки това, Лапулапу, лидерът на Мактан, [28] се противопостави на обръщането. [29][30] За да спечели доверието на Раджа Хумабон, [31][32] Магелан отплава към Мактан с малка сила сутринта на 27 април 1521 г. По време на последвалата битка срещу войските на Лапулапу, Магелан е ударен от бамбуково копие, а по-късно заобиколен и завършен с други оръжия.[33] Антонио Пигафета и Гинес де Мафра предоставиха писмени документи за събитията, които кулминират със смъртта на Магелан: Когато настъпи сутринта, четиридесет и девет от нас скочиха във водата до бедрата си и преминахме през вода повече от два полета с арбалет, преди да успеем да стигнем до брега. Лодките не можеха да се приближат по-близо поради определени камъни във водата.
