Filmul spune povestea a patru comenzi pinguin - excentricul strateg Kowalski, un specialist în sarcini explozive Rico, cel mai tânăr și cel mai mic serial și liderul grupului Skipper. Pinguinii luptă împotriva organizației secrete a vântului de Nord, formată din lupul polar al agentului secret, sigiliul detonatorului Groenlandez, caporal de ursuleț muscular și bufnița de vultur a Evei, pentru a înfrunta răul doctor Octavius Mackiewicz, care se dovedește a fi caracatița răutăcioasă Dave și vrea să distrugă pinguini din întreaga lume.
