A Fülöp-szigeteken töltött több hét után Magellán 2200 helyi lakost térített keresztény hitre, köztük Rajah Humabont Cebuból és a Cebu körüli szigetek legtöbb vezetőjét.[27] Lapulapu, a Mactan vezetője[28] azonban ellenállt a megtérésnek.[29][30] Rajah Humabon bizalmának elnyerése érdekében [31][32] Magellán 1521. április 27-én reggel kis erőkkel Mactanba hajózott. A Lapulapu csapatai elleni csata során Magellánt egy bambuszlándzsa ütötte el, majd később. körülveszik és más fegyverekkel végezték el.[33] Antonio Pigafetta és Ginés de Mafra írásos dokumentumokat nyújtott be a Magellán halálába torkolló eseményekről: Reggelre negyvenkilencen ugráltunk combig a vízbe, és több mint két számszeríj-repülésen keresztül mentünk a vízben, mielőtt a partot elértük volna.. A vízben lévő sziklák miatt a hajók nem tudtak közelebb menni.
