Abocado desde sus inicios al desarrollo del fútbol pronto adquirió un carácter multideportivo y desarrolló varias otras disciplinas las cuales algunas fueron desapareciendo con el devenir de los años. La gestión del equipo de fútbol es responsabilidad de una sociedad filial del club llamada FC Bayern München AG, desde 2002 bajo la dirección del exfutbolista Karl-Heinz Rummenigge, que gestiona el patrimonio económico y las actividades en el Allianz Arena. El 75.1 % del capital de esta sociedad anónima es del club, el otro 24.99 % se divide entre las empresas Adidas AG, Audi AG y Allianz SE.
Es el club más laureado en la historia de la Bundesliga, con 28 títulos ligueros incluyendo el Campeonato Alemán de 1932, cuando el torneo todavía no se encontraba bajo su actual formato unificado. También lo es de la Copa de Alemania : posee 18 trofeos.
A nivel internacional, el Bayern fue tercero —Con un voto menos que el Manchester United— en la elección del Club del Siglo de la FIFA, mientras que en el estudio realizado por la IFFHS para determinar al mejor club del siglo xx, ocupó la novena y quinta posición en el mundo y Europa respectivamente. Igualmente, es uno de los cinco equipos que se ha ganado el derecho a conservar en propiedad la Copa de Europa y utiliza un distintivo de múltiple campeón del torneo, que ganó de forma consecutiva en 1974, 1975 y 1976. También es uno de los tres equipos en lograr el triplete y ganar, además, la Copa Mundial de Clubes en el mismo año, que logró en la temporada 2012 -13.[Nota 2] Juventus de Turín, Ajax de Ámsterdam, Manchester United y Chelsea son los otros cuatro clubes que han ganado las tres grandes competiciones; la Liga de Campeones de la UEFA, Recopa de Europa y la Copa de la UEFA.
En el máximo torneo europeo de clubes, la Liga de Campeones de la UEFA, el Bayern de Múnich ha disputado un total de 10 finales, 18 semifinales, 27 cuartos de final, en 34 participaciones, 324 partidos jugados, 185 victorias, entre otros registros históricos, que le sitúan, por clasificación histórica y puntaje, sólo por detrás del Real Madrid en este torneo. En cuanto a títulos conquistados, es tercero con cinco trofeos, igualado con el Liverpool y el Barcelona, por detrás del Real Madrid con trece y el Milan con siete.
En el plano deportivo el equipo bávaro matiene una rivalidad con varios clubes.
